3月3日，印尼外交部针对陈水扁宣布终止“国统会”和“国统纲领”发表声明说，印尼政府密切关注台湾海峡局势的发展，认为台湾当局做出终止“国统会”和“国统纲领"的决定加剧了该地区的紧张局势。印尼政府呼吁有关方面不要采取任何不利于该问题和平解决的行动。
同日，印尼人民协商会议副主席法特瓦在接受我《人民日报》和新华社记者联合采访时谴责陈水扁宣布终止“国统会”和“国统纲领”，认为这是对和平解决台湾问题制造困难。他呼吁陈水扁恢复“国统会”和“国统纲领”的作用。
法特瓦说，台湾当局的举动将加剧台海地区紧张局势，影响全球特别是亚太地区的安全与稳定。他表示支持印尼政府一贯坚持一个中国原则，呼吁东盟国家就缓解台海紧张局势，不支持陈水扁的政策达成一致。
